Oscar Piastri liderou as tabelas de tempo do segundo treino livre que teve quatro bandeiras vermelhas em uma sessão agitada.
As equipes e os pilotos tiveram suas corridas planejadas prejudicadas devido a três bandeiras vermelhas que eliminaram a maioria do tempo da sessão.
Jack Doohan foi o primeiro a causar a bandeira vermelha após apenas dez minutos, saindo da pista na curva 1 e batendo de lado no muro, danificando severamente seu Alpine, completando quatro voltas na sexta-feira depois que Ryo Hirakawa assumiu o lugar do australiano no TL1.
Fernando Alonso foi o próximo a causar a bandeira vermelha e interromper a sessão, colocando uma roda de seu Aston Martin na grama na curva 8, perdendo o controle e rodando para fora na brita, mantendo-se longe das barreiras para reduzir a quantidade de danos feitos.
As duas últimas bandeiras vermelhas que ocorreram foram causadas por dois incêndios provocados por faíscas que incendiaram a grama, incendiando a parte externa da pista e causando uma preocupação real para os organizadores em Suzuka.
Como resultado de todas essas interrupções, alguns pilotos nem conseguiram usar seus pneus macios, mas Piastri conseguiu fazê-lo, ficando +0,049 mais rápido que seu companheiro de equipe Lando Norris.
O piloto da Racing Bulls Isack Hadjar fechou o top três com uma volta excelente, ficando à frente de Lewis Hamilton em P4, enquanto Liam Lawson no outro Racing Bull terminou em quinto.
George Russell e Charles Leclerc estavam em P6 e P7, respectivamente, enquanto Max Verstappen só conseguiu o P8 com sua volta com pneus macios, com ambos Racing Bulls à sua frente.
Pierre Gasly e Carlos Sainz fecharam o top então, enquanto Yuki Tsunoda ficou em P18, não conseguindo fazer uma volta com pneus macios, assim como Kimi Antonelli em P16.